1 合理使用潔凈實驗室和凈化工作臺，達到設定的凈化標準要求。首先，無論是紫外線殺菌還是空氣過濾凈化，均需要作用時間，如100級凈化需要送風30min以后才能使用，紫外線照射時間也不宜少于30min。其次，一定面積內的潔凈室(區)允許進入的人員數量有限，如果超過限度，則空氣過濾系統難以及時帶走新產生的塵埃和微生物。凈化工作臺內也不應放入過多的實驗物品。
2 規范實驗人員操作。杜絕實驗人員將污染物直接帶入實驗材料中的直接污染，避免由于環境污染了實驗人員而引起的間接污染。
3 注重及時處理實驗過程中的廢棄物。一般實驗室中對“清潔”的概念多停留于實驗結束后的清潔與處理，但實驗過程中廢棄物在持續地向實驗區域發散微粒及微生物，雜亂無章的環境還會增加實驗誤操作的危險。故注重對實驗過程中廢棄物的處理，將其暫存于指定位置，以及維持操作環境一定的整潔度，可以對防止實驗污染起到很重要的作用。
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